中秋過后，一天清晨，鄭芝龍叫醒朱常鴻等眾俠道：“殿下，前面便是普陀山了！”眾俠大喜，都到甲板上看。此時太陽初升，普陀山在一片曦光的映照和朝霞的襯托下顯得祥光萬道，瑞氣千條。鄧清喝彩道：“這普陀山好美的風景！”梁復道：“這普陀山相傳便是觀音菩薩的道場了，今日一見，果然有仙山氣象！”倭國船在梵音洞附近靠岸，此處離靜逸師太出家的普陀禪院還有挺遠的一段路程。
眾人上岸時，遠處人影一閃。阮鶴亭機警，首先察覺到，面色一變。鄭翠翎看見阮鶴亭神色稍變，便問道：“阮駙馬有何事？”阮鶴亭怕說出來會讓大家人心惶惶，便笑著道：“沒事啊，或許是我還沒睡醒，頭昏眼花吧。”走了一路，眾人來到了普陀禪院前，只見禪院的牌匾都不見了，院門東倒西歪，零零落落。推開看時，忍不住心中凄慘：長廊寂靜，古剎蕭疏；苔蘚盈庭，蒿蓁滿徑；滿眼飛蟲影，到處蛙聲喧。
鄭翠翎見狀，嘆了口氣道：“此處眼看凋零已久，怕是因為靜逸師太師徒去了趟福建，島上之人怕再受到倭寇侵擾，故此都逃生了吧？”捧著師父和師妹骨灰罐的于瑞雪觸景傷情，不禁淚如泉涌。素來和于瑞雪慪氣的鄧清此時卻第一個舞起鋤頭，為靜逸師太師徒二人挖墳。眾人看見連鄧清都如此熱心，便都幫起于瑞雪的忙了。阮鶴亭忽道：“此處無香燭祭拜靜逸師太，我去搞點回來。”轉身便走。
眾人心中納悶：“沒香燭撮土為香便好，此島上空無一人，有錢也買不來香燭。”話還沒說完，但見阮鶴亭已經揪著一個白凈面皮，四十來歲的中年人回來。原來甫一登島，阮鶴亭便覺察到被人監視了。方才埋葬靜逸師徒骨灰時，阮鶴亭更是聽到了不遠處有外人的呼吸之聲，故此隨便找個借口走開，施展輕功繞到此人后面將之擒住，并扭送了過來。徐光啟一見，便驚叫道：“我徒，你怎會在此？”那人看見徐光啟，也轉驚為喜道：“徐老師，有日子沒見了！”徐光啟便向眾人引見此人。
原來此人名叫孫元化，松江府嘉定縣高橋何家弄人，曾到上海縣徐光啟學館授業，故此和徐光啟師徒相稱。萬歷四十年中了舉人后，孫元化便跟著徐光啟學習火器和數學，只因熱心西學，未能考中進士，遂放棄科舉功名，潛心研究西學。孫元化因恩師徐光啟接觸到西洋教士和西學，于是也和老師一般信了天主教。他認為佛法能和天主教、儒術一道補益王化，而自己原先便是個參加科舉的儒生，后來又入了天主教，就是苦于對佛教頗不了解，于是便決心到這離嘉定縣最近的佛家圣地普陀山鉆研佛法，不曾想此地已經荒無一人了。后來孫元化便猜想是否此島受倭寇侵襲而荒廢了，正想逃離時，剛好遇著眾俠和鄭芝龍及其手下的倭人海盜上島，故此孫元化便疑慮監視著。